El CIME instala  en el año 1956 sus oficinas en Uruguay, para el desarrollo de programas de traslado de migrantes desde Europa.
El 20 de abril de 1965 se aprueba la Constitución de la OIM (CIME en aquel entonces) por la Asamblea Nacional, para después incluir a la República Oriental del Uruguay como Estado miembro ese mismo año.

Gracias a la promulgación como Ley del Convenio de Cooperación entre la República Oriental del Uruguay y la OIM, el 8 de septiembre de 1993 se fija el marco legal que ha permitido el desarrollo de los programas, los proyectos, y la acción permanente de la Organización en Uruguay.

Actualmente, en cumplimiento de su principal mandato, la Misión de la OIM en Uruguay acompaña los esfuerzos nacionales en materia migratoria con el fin de ayudar a encarar los desafíos que plantea la migración en el país.